斑马鱼高通量图像采集系统

斑马鱼幼体高通量图像采集自动操作系统

VAST BioImager™ Platform 

 

VAST BioImager系统是专门为2-7天幼体斑马鱼的高通量图像采集而设计。该系统是在美国麻省理工学院Yanik实验室开发的技术的基础上发展而来。VAST BioImager在采集图像之前自动完成斑马鱼幼体装载、定位、旋转等操作，避免了在进行高通量图像采集时对斑马鱼幼体人工操作的时间损耗和冗长的步骤。同时它也是一个组装式和可拓展的平台，能安装在多种直立复式显微镜或者立体显微镜上进行高分辨率、细胞水平上的图像采集。

型号：VAST BioImager

产品特点：

· 适用于高通量&高内涵筛选

· 可安装在多种直立复式显微镜或者立体显微镜上

· 可安装在荧光显微镜上进行荧光图像采集

· 配合高阶分析软件，可实现对斑马鱼的高精度定位和高分辨率成像

· 可选配LP Sampler自动加样器，可实现从96孔板中取样，传送斑马鱼幼体到VAST系统进行图像采集

 

主要功能：

· 专为模式生物研究而设是斑马鱼研究的有力工具

· 自动处理图像采集前斑马鱼幼体的各种操作

· 避免人工操作的时间损耗和冗长的步骤

· 在软件上点击“Load one Fish"，VAST就会装载好一个斑马鱼幼体

· 系统可将斑马鱼幼体进行360°旋转定位，从侧面、背面或者其他方向进行图像采集

高分辨率显微镜载物台和安装套件

VAST配合实验室的显微镜一起使用，一旦使用机载摄像头定位幼虫，VAST内部光源就会关闭，并且可以使用显微镜的光学器件和摄像头捕获高分辨率图像；

在配备荧光功能的显微镜上安装 VAST 可以收集荧光图像；

多角度成像

将斑马鱼幼体进行360°旋转定位，操作者可根据自己的意愿选择方向，侧面、背面或者其他方向进行图像采集。

高阶版 VAStomography™ 软件（选配）

能够在几分钟内生成3D光学投影断层扫描 (OPT)
选定感兴趣区域的体积、形状和位置数据集
使用 VolView/ParaView 进行 3D 可视化
使用 MATLAB/Python 进行数据处理

从用 Col2-H2a-mCherry 标记的 4 dpf 斑马鱼幼虫的荧光图像构建断层扫描

A 腹面观，B 侧视图，C 用VASTomography 软件对同一条鱼进行3D断层扫描

手动加样器

手持式流通式移液器通过单击按钮，将斑马鱼装载到 VAST中

LP Sampler自动进样器

能够实现对多孔板样品的自动化加样

完整的图像采集系统

VAST斑马鱼高通量图像采集系统可配合LP Sampler组成一套更加完整的高通量拍照平台

能够实现从多孔板自动进样到显微镜成像平台

VAST BioImager的部分文章：

·Nature Methods, 2010, 7 600-601 and 634-636, Carlos Pardo-Martin, Tsung-Yao Chang, Bryan Kyo Koo, Cody L Gilleland, Steven C Wasserman and Mehmet Fatih Yanik

·Lab Chip, 2012, 12 711-716, Tsung-Yao Chang, Carlos Pardo-Martin, Amin Allalou, Carolina Wählby and Mehmet Fatih Yanik

·Nature Communications, 4, Article number:1467, doi:10.1038/ncomms2475, Carlos Pardo-Martin, Amin Allalou, Jaime Medina, Peter M. Eimon, Carolina Wählby, Mehmet Fatih Yanik

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